NLP /即资源

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下载自动去识别模型许可证

访问自动去标识算法的github

自动化模型的去识别算法应用于侵蚀性去标识到字共现模型而不牺牲对多义性能。而一些很普通的话,必须包含在模型(即名字在他们的一些事件,如“白”),去识别过程中消除任何不专业词汇的一部分,并在患者信息数据库的任何字(例如,姓名和地址)。一个例外,以保持良好的字消歧性能的关键,是在患者数据库中的2000个最常用的词包含在模型中,允许像同音的“白”,如上面提到的。

biomedicus

biomedicus

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生物医学信息收集和了解系统(biomedicus)利用文本分析的开源解决方案和生物医学和临床报告,处理和分析的文本提供新的分析工具。该系统是由我们的生物医学NLP /即程序在明尼苏达大学开发。这是一个合作项目,旨在服务于生物医学和临床研究人员,允许有不同的文本定制。

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访问家族史模块示范

家族病史信息对于了解疾病的风险是至关重要的。它是,更具体地,用于个性化的疾病预防,诊断和治疗的关键。我们以前的工作包括分析在EHR家族史的信息表示,发展更全面的家族史表示模型。 biomedicus包括家族史模块,其识别家族史语句,观测(例如,疾病或过程),相对或家庭用的属性(即,重要的状态,诊断,确定性,和否定的年龄)和断言(“指示符的侧被用于建立观测和家庭成员之间的关系,短语”)。

HL7 / LOINC文件本体:角色轴评测

HL7 / LOINC文件本体:角色轴评测

提出的扩展层次(高级别)的角色

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HL7 / LOINC文件本体:设置轴评价

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提议的扩展到HL7 / LOINC文件本体设置轴

的HL7 / LOINC文件本体(DO)是提供临床文档元数据中包括五个轴的分层结构的标准表示一个本体:种文件(KOD),服务类型(TOS),设置,主题域( SMD)和作用。该做支持跨组织和系统的临床文档交换也便于检索和研究等二次使用的文档重用。大量的研究,但是,说明在做轴值的扩展需要。此数据集与不同数据源的评价,这到了一个重新组织层级与当地研究型临床数据存储库254个的附加价值创造,CMS服务到位(POS)代码集,明尼苏达州的医疗保健计划(MHCP)供应商手册,对于设置明尼苏达电子健康记录任务的指导下,HL7第3版(V3)代码集,以及国家医疗安全网(nhsn)。

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了解更多关于NLP墩

码头(研究患者信息提取)是一个信息抽取(IE)平台,可提供对存储在临床笔记自由文本病人数据的直接访问。码头的底层框架使用elasticsearch技术和功能明尼苏达临床NLP /即程序的开源自然语言处理(NLP)应用程序,biomedicus(生物医学信息的收集和了解系统)的大学。这种资源的目的是服务于生物医学和临床研究人员,是的NLP / IE程序之间的协作努力的结果,临床转化科学研究所(CTSI),明尼苏达超级计算学院(MSI),以及学术健康中心信息系统的研究开发和支持团队。

NLP标签

NLP标签

访问NLP标签

我们提出NLP类型和注释浏览器(NLP标签),有利于探索和NLP应用程序及其组件的分析没有他们执行的先验知识的开源系统。通过存储和分析由上使用类型无关的数据模型的一个或多个语料库每个NLP应用所产生的结果,我们允许用户发现哪个注解注释类型的单独之间最佳匹配其特定信息检索任务,以及,运行比较应用。

NLP标签的最终目标是促进信息提取系统,其利用多个NLP应用程序使用Apache非结构化信息管理(UIMA)平台上开发成果的开发和部署(http://uima.apache.org/),最大限度地发挥他们的相对优势和尽量减少他们的弱点。要实现这一目标,NLP标签有三重目的。首先,它允许用户探索和评估不同的NLP应用和他们所创造的注解通过几个可视化和信息检索技术。第二,它结合了用于随后的信息检索不同NLP系统的结果。这里,利用多个NLP应用可提高准确度和从医学教科书信息提取的可靠性,特别是当应用NLP产生互补的结果。 NLP-标签旨在阐明了不同的NLP应用是互补的程度。第三,NLP标签,最终可能使部件从通过分析和无监督创建的数据类型之间的映射的不同管道中的重用和互操作性。

语义相似性和关联包

语义相似性和关联包

在UMLS相似性是一个开源perl软件包用于相似性和相关性的措施。目前包实现的各种语义,例如基于在统一语言医疗系统(UMLS)和WordNet中发现本体和术语边缘计数,信息内容,最短路径,等等。封装之间对输入医学概念取决于所选度量类型指示它们是如何相似或相关的分配数值。

全球第一体育必威官网 http://search.cpan.org/dist/umls-similarity.

感库存

感库存

临床缩写感库存

http://purl.umn.edu/137703

A sense inventory is a collection of abbreviations and acronyms (short forms) with their possible senses (long forms), along with other corresponding information about these terms. For our comprehensive sense inventory for clinical abbreviations and acronyms, a total of 440 most frequently used abbreviations and acronyms were selected from 604,944 dictated clinical notes. 949 senses of each abbreviation and acronym were manually annotated from 500 random instances within clinical notes and lexically aligned with 17,359 long forms of the Unified Medical Language System (UMLS), 5,233 long forms of Another Database of Abbreviations in Medline (ADAM), and 4,879 long forms in Stedman’s Medical Abbreviations, Acronyms & Symbols (4th edition).

临床符号意义库存

http://purl.umn.edu/137704

虽然临床文本包含许多符号,相对很少有人注意医疗自然语言处理(NLP)的研究人员给符号解析。解释符号的含义可被视为多义(WSD)的一种特殊情况。的四种常见非字母数字符号千个实例(“+”,“ - ”,“/”和“#”),随机从临床文档储存库中提取与由专家注释。去标识的数据可用于研究。

手术动作与谓词映射

手术动作与谓词映射

http://purl.umn.edu/137705

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