健康信息请音箱系列

被邀请的音箱系列是我们的健康信息学大查房的延伸。在这个系列中,来自全国各地的顶级信息学将分享自己当前明尼苏达信息学社区大学的研究。这个系列是向公众开放,并现场直播。事件的记录可以在下面找到链接。 

该系列一般会在星期四从3:30-4:30,但日期和时间可以变化。

分子亚型和在转录药物靶点发现/剪接变体(同种型)的水平

分子亚型和在转录药物靶点发现/剪接变体(同种型)的水平

博士。拉玛纳DavuluriDavuluri
预防医学教授
卫生和生物医学信息 
医学Feinberg医学院
足球 有个拉人的视频直播 

周二,12月3日
上午11点十五至下午12时15
穆斯2-530 

随着遗传学每个连续发现的基因结构和基因调控有动态复杂性日益明显。了解,这是现在大多数人的基因产生多种功能性产品,或亚型,主要是通过替代转录和拼接。内的不同同种型相同基因已经显示在不同的功能途径参与其中,并且具体同种型的改变的表达进行了关联与许多癌症。因此,转录基于基因为中心的信息学方法分析; (A)可能导致资源浪费跟进,不能复制的,因为他们都是假的,(二)“引线”可能导致丢失重要的发现应该已经发现,和基础生物学最重要的(C)误解。

在这次讲座中,我将介绍最新的机器学习方法,其中一些是基于“旧观念,”以账户为基础剪接和应用成绩单变体。这些方法是使用信息学我们最近的与平台无关的分子信息学管道胶质母细胞瘤和卵巢癌的亚型分类发表的研究说明。我将讨论我们对在亚型/剪接变平的药物靶基因发现正在进行的工作存在。 

精神科再入院的风险提高预测

精神科再入院的风险提高预测

提高精神再入院风险预测在精神病患者的电子健康记录的自然语言处理

Dr. Hall

博士。美华厅 
精神病学副教授 
哈佛医学院 
精神病神经生物学实验室

2019年10月1日
上午11点15 - 下午12时一刻 

2-530穆斯塔
现场直播

概要: 精神障碍通常出现在青春期后期或成年早期,影响约2.5-4%的人口,使他们的全球残疾的主要原因之一。精神病患者高达13%的排放后不久再次入院。再住院冲击了患者和家属,而且医疗费用上升的主要动力。仅在2009年,在精神疾病再次住院的费用已经总计为$ 832十亿。

博士。大厅的研究重点是利用多途径患者的神经生物学和临床特征与其功能的恢复轨迹联系起来。她研究的首要目标是具有不同功能的恢复路径识别个人身份,并制定个性化定制和有效的治疗。在这次讲座中,她将提出旨在运用自然语言处理(NLP)和机器学习技术来提取患者的电子健康记录(EHR)从非结构化临床叙述有意义的信息,并用于评估和预测的精神病患者再住院风险创建工具项目。

在optumlabs研究协作:一个独特的学术/工业合作伙伴关系

在optumlabs研究协作:一个独特的学术/工业合作伙伴关系

     

托马斯河克兰西,工商管理硕士,博士,注册护士,FAAN
临床教授,名誉上
护理明尼苏达大学法学院
明尼阿波利斯,明尼苏达

lisiane pruinelli博士,RN
助理教授
护理明尼苏达大学法学院
明尼阿波利斯,明尼苏达

让·F。黄伟文, 博士,注册护士,APRN,GNP-BC,FAAN,fgsa
在护理研究教授和科拉meidl siehl椅子
护理明尼苏达大学法学院
明尼阿波利斯,明尼苏达

2019年9月11日
2-690穆斯塔
下午2:15 - 下午3时15分
现场直播

概要: 在optumlabs研究协作是一个独特的内部专业,学术/工业合作伙伴关系,为研究人员提供访问链接的健康保险,电子病历和消费行为数据为200多万病人的病历。明尼苏达大学是研究合作现在包括27个学术和专业组织的创始成员之一。明尼苏达教师多个大学已经用于资助的研究的optumlabs数据仓库(oldv)。护理明尼苏达大学医学院充当明尼苏达教员的任何一所大学谁希望访问数据库用于研究目的的技术支持中心。该报告将提供科研合作,目前研究的概况,并展示教师有或没有信息学背景如何利用oldv在大型复杂的数据库进行研究。

信息学的新时代:异构数据源的数据科学

信息学的新时代:异构数据源的数据科学

Jiang Bian博士。边江,
生物医学信息学副教授,
癌症信息学和电子保健核心项目的主任,
佛罗里达大学

2019年8月20日
3:30 - 下午4:30
2-690穆斯塔
记录

概要: 这个演讲将讨论承认,利用和生物医学研究整合异构数据源,从精密医学精密公共卫生学习卫生系统的重要性。

生物: 博士。陈水扁目前是生物医学信息学在佛罗里达大学的副教授,和癌症信息学和电子保健核心方案为用友健康癌症中心主任。他在数据科学,语义网和本体,自然语言处理,社交媒体,网络科学,数据保密,电子医疗和以用户为中心的设计和软件工程的一个多元化但强大的多学科背景。  

足球 有个拉人的视频直播

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Alexander Alekseyenko, PhD亚历山大诉alekseyenko
方案人类微生物研究
生物医学信息中心
南卡罗来纳医科大学

足球 有个拉人的视频直播
3:30 - 下午4:30
2-690穆斯塔

现场直播

概要: 微生物是用来描述殖民我们的身体所有微生物的集合的术语。而了解人类基因组已收到近20年来的巨大关注量,主机相关的微生物基因组在人类健康和疾病的影响(宏基因组)和它们的功能仍然是被概念化的早期阶段。近期中,微生物学激增已经通过提供技术,如高通量DNA测序,质谱分析,自动细胞分选等提高可用性最引人注目的,当然,测序数百个人微生物组在单次运行的能力测序仪器已造成微生物群落剖析数据集处理的生物医学问题繁多的完美风暴。本演示将激励对微生物的具体数据分析技术的需求。我将突出一个总体框架的几个有前途的分析方法和要素整合高维主机微生物的数据。我也将描述信息学如何通过经由活μbiome银行从临床相关的患者群体简化到人类微生物标本研究访问加速微生物研究。

AI医疗保健 - 弥合人类智慧和机器智能之间的差距

AI医疗保健 - 弥合人类智慧和机器智能之间的差距

Picture of Hongfang Liu烘房刘博士
生物医学信息学的教授,医学的梅奥学院 
椅,数字健康科学部
主任,生物医学信息学,临床和转化科学的梅奥诊所中心
主任,临床自然语言处理程序

周四,4月4日
下午2:30 - 3:30
2-470菲利普斯wangensteen建设
记录

概要: 足球 有个拉人的视频直播

生物医学信息学和医学精密正在铺设的框架,为下代发现

生物医学信息学和医学精密正在铺设的框架,为下代发现

Picture of Sean Mooney肖恩·穆尼博士
教授,生物医学信息学和医学教育部门
首席研究信息官,UW医学
华盛顿大学

周二,3月5日
12:00 PM。 - 1:00 PM。
2-650穆斯塔
链接现场直播

概要: 它是在研究和生物医学信息学应用到从事的大好时机。使用电子和个人健康档案和个人移动设备的增加是建立在研究的学术医疗中心的机会。在华盛顿大学,我们在地面的铺设工作,建立信息学和信息技术基础设施,以支持个性化的方法进行研究,我们开始看到这些努力的早期成功。有很多的挑战,例如,全外显子组和全基因组测序将继续挑战具有丰富的未知疾病影响的遗传变异的研究。外显率和表型表现度的遗传原因往往没有已知的分子基础。在这个演讲中,我将讨论我们的支持UW医学研究中使用的数据,我们的努力,以建立新的机器学习与数据科学方法临床使用的数据集,并努力开发新的方法来解释人类基因组序列。进一步,我们通过组织和参与社区的挑战(关键评估)建立一个更好的了解,在基因组的解释和在什么情况下表现良好的类型的方法的利用人群。我将描述数据的健康(CD2H)以及我们如何促进整个CTSA程序信息学全国和集线器如何CTSA可以进一步利用CD2H中心新成立的中心。 

信息学在人口精度健康方面的作用

信息学在人口精度健康方面的作用

马克·威廉姆斯,MD马克·威廉姆斯,MD 
导演,基因组医学研究所

11月26日
3:30 - 下午4:30
2-470菲利普斯wangensteen建设
记录

概要: 这个演讲将提供的术语和随后格伊辛格精度健康工程,mycode的社区健康计划的演示精度健康的新兴领域的理念的简要概述。重点将放在信息系统,并支持精密健康计划强调了差距和机会,实施研究所需信息学的方法。

该fask算法循环模型,其应用

该fask算法循环模型,其应用

Joseph Ramsey, PhD约瑟夫·拉姆齐,博士
特殊的教师和 
研究计算主管
理念卡内基 - 梅隆大学的系

10月23日
3:30 - 下午4:30
2-470菲利普斯wagensteen建设
记录

足球 有个拉人的视频直播足球 有个拉人的视频直播

生物: 博士。拉姆齐获得了博士学位。在加州大学圣地亚哥分校,与认知科学为重点的理念。他曾在许多赠款资助的项目,与NASA Ames研究中心的工作开始使用矿物光谱检测岩石中的碳酸盐,使用因果算法,然后在软件的自然演绎,和几个项目的应用因果关系的研究,以在各领域的实际科学问题,包括细胞生物学,野火分析和功能磁共振成像时间序列的因果分析,给出了几个。自1998年以来,他一直在四分体项目,因果分析的一个开源项目,在那里他设计并实施了很多因果搜索算法,其中一些已经走在科学界中使用的主要开发者。他目前在卡内基 - 梅隆大学为研究计算,在那里他自1998年以来的导演理念的教师。 

平移信息学在癌症精密医学认为:从血液恶性肿瘤和自身免疫性疾病的见解

平移信息学在癌症精密医学认为:从血液恶性肿瘤和自身免疫性疾病的见解

Picture of Matthew Breitenstein马修·布莱博士
Instructor of Informatics Department of Biostatistics, Epidemiology & Informatics, Perelman School of Medicine, Senior Fellow – Institute for Biomedical Informatics (IBI), Senior Fellow – Center for Pharmacoepidemiology, 研究 & Training (CPeRT), University of Pennsylvania, Philadelphia, PA

9月18日
3:30 - 4:30时三十分
2-580穆斯塔
记录

这个演讲将突出平移信息学为癌症控制设置中前进精密医学知识的方法。具体地讲,在从多组学的比较和反向翻译得到的见解充当用于治疗的个性化或前进疾病的机械/病因见解的枢轴。 科学,这个谈话将集中分别弥漫性大B细胞淋巴瘤和系统性红斑狼疮,B细胞恶性肿瘤和自身免疫病症,内,和重叠的靶向疗法。应答的新颖的药物基因组学行列式利妥昔单抗使用平移信息学方法在深度将要讨论的识别。